mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGGTAGCCAAGGATGACTTG GTCTTCTTGGCTAACTTGAC GGGAAAATGAAGAGGGACCTTACATGAAGGGAACAATGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTTGCTTTCTCTCAAAGGATTTATTTATATCAAGACCTTTGTTAGACTGGTTATCAGGCAGTCTTCTTGGCTAACTTGACAATTTCTTCCCTAATTTCATGTTAGATCTCCTTTTCTA GGGAAAATGAAGAGGGACCTTACATGAAGGGAACAATGTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGTTGCTTTCTCTCAAAGGATTTATTTATATCAAGACCTTTGTTAGACTGGTTATCAGGCAGTCTTCTTGGCTAACTTGACAATTTCTTCCCTAATTTCATGTTAGATCTCCTTTTCTAATCTCGTTTCTTGATGGCCGTATGAGTTCTATGTAATAAATACATAAGAGGGGGAATCTAAATATTGTGTGTATTTTCATATTTTCTAGTCCCATGATTTACGTGTACTTTTCTATATGTATCAAACTCACAGGGGTTATGGTAACATGCCAAGACATTCTAACATCTTTGTGATAAAGACAAAGTTTTGGGAGGGAGATCCTGAAAGTAGTT 2 2 5' arm Lactuca_serriola mirnest MIR169_5 0.00000004 ptc-MIR169k 0.000000002 -66.2 ........(((((((((.((.((((((((((((.((..((((.((((((((((((.((((.(((((..(((.(((..((((((.(((.........))).))))))..)))..)))...)))))))))))))))))).))).))))..)).))))))....)))))).)).)).))))))).. (-66.2)