mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATGTTCATCATCATCGTCT TGATGATGATGATGATGATGATG ACAACTTCCATTTCTCAATTTCAACTTATTCTACTTCTACATCATGTTCATCATCATCGTCTTCCTTTAGTTTCTTTAGCTTTAGACCCTTCAATAAGCGGTTTCATTTCATTAACCCACCTCGTTCTTCCCTCAAACAAACCAAAAAACAGCAACGAACCCTTCAAACTAATGCCCCACCACCACAAAGCAGCATCAGAAGACTCTTGAACTTGAACGATAATCCTAAAGACGATGGTGGTGGCGGAAATGATGATGATGATGATGATGATGATGATCAGAACGAGACTGCGATTAAGGGGACAATTTTA GCGGGGGGGATTGGTGTCCGCCTACAAACCGTATAAAAATGAGAGGAACAGCGCTCATCTTCTTTGTTCTTCTTATCTTGAAGAATCCACTGTTTATCGAACTCTAAACAGAAATCATCCACTTAGAATGCGCATCCTTTCGAGGCCACCGTGCCTCTCATCATATTCTGCTCCTTCTCGATCTCAATCACTCGCCAGACACAACTTCCATTTCTCAATTTCAACTTATTCTACTTCTACATCATGTTCATCATCATCGTCTTCCTTTAGTTTCTTTAGCTTTAGACCCTTCAATAAGCGGTTTCATTTCATTAACCCACCTCGTTCTTCCCTCAAACAAACCAAAAAACAGCAACGAACCCTTCAAACTAATGCCCCACCACCACAAAGCAGCATCAGAAGACTCTTGAACTTGAACGATAATCCTAAAGACGATGGTGGTGGCGGAAATGATGATGATGATGATGATGATGATGATCAGAACGAGACTGCGATTAAGGGGACAATTTTAGCTGGTTTGTTGCTGGTGGGTGTTGTTGGTGGGTTTGGTACTGTTGGGTACATCTATAGAGACCAGATCAATGCTTTTCTGATTCAGTTTTCTAGCTTCATTGAAGGATATGGCCCTGCTGGATATGCACTTTTTGTTGCAGTTTATGCTGGCTTGGAGGTACTTGCAATCCCCGCGATCCCACTGACAATGTCAGCGGGTCTACTTTTTGGGTCATATACAGGCACAATTCTTGTCTCCATAAGTGGAACTGTGGCTGCAAGTGTTGCATTTCTAATTGCTAGATATTTTGCTCGTGATCGGATACTTAAAATGGTTGAAGGCAATAAAAAATTCCCTTGCATCGATAAAGCAATTGGAGAAAATGGTTTTAGAGTTGTCACAC 2 2 5' arm Lactuca_serriola mirnest 100 100 -54 ......(((....((.((((.((.(((.((((...((..((((((..((((((((((((((((((...((((.....))))..((((((((....))).)))))((((.............(((((((......................)).)))))............))))..(((((((((.....(((..((((.......))))..)))....................))))))))).))))..))))))))))))))..))))))..))..)))).)))..)).)))).)).)))........ (-54)