mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTATGAATGCTGAAGATGTGA ATATCAAGGGCAGACATGGCA TTTATGCGGTGGTATGTATGTTATGAATGCTGAAGATGTGATGATTATATCAAGGGCAGACATGGCATTTGATGCGGGTGATTA TTTATGCGGTGGTATGTATGTTATGAATGCTGAAGATGTGATGATTATATCAAGGGCAGACATGGCATTTGATGCGGGTGATTAGAAGATAACTGCTATCGTTATATTTTTTTCTCAAGAATTGTCCACATTGAGAGCTCTGTAACTAGATAATGTTTCTGTGGAAATTTATAATAATAATGATTTTCTGTTTGTGCATGAAA 5 0 5' arm Lactuca_virosa mirnest 100 100 -19.5 ....((((....((...((((((((..((((...(((((((...)))))))...))))..)))))))).)).))))........ (-19.5)