mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATGTTGGAATGGCTCAATC TTGAGCCGTGCCAATATCATG TTGTTGGAGATGGTAACGTGATGATGTTGGAATGGCTCAATCAAATCAGATCTCCCCGGATGAATCAACAGGGTGTTTTAGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCATGAACTACTGTTAATTTGTA GCGGGGATTCTTCTTCTTTGTCTTACTTTTGATACTTGTATTTCTTGAAGATAGTCGACAGATGCATTCCGAAAGCTGTAAGAATTCCAAGTAAGGGATGAAAACCCAGATTTAATATTAGTTATTGTGTGGTATATATTGTTGGAGATGGTAACGTGATGATGTTGGAATGGCTCAATCAAATCAGATCTCCCCGGATGAATCAACAGGGTGTTTTAGTTTGATTGAGCCGTGCCAATATCATGAACTACTGTTAATTTGTATTTATTGTATTTGATTAAGATAATTCTGAACAGAAATACAAAAAGTTTGTGTACATATATATGTTCATGCTCTT 1 0 5' arm Lactuca_virosa mirnest MIR171_1 7.0E-9 tcc-MIR171f 1.0E-10 -42.6 ........(((((((..((.((((((((((.(((((((((((((((.(((...(((..((....))....)))...))).))))))))))))))).))))))))))..)))))))))........ (-42.6)