mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA CATGTGCCCATCTTCGCCATC GATGAGCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCATCATGAAGACCTAGAAAAGTTTTGCGTTAAGTAAACCTTGAAGGTGTTAATCCAACGTACCTAACCTAGCCAAATAGCCTTGAAGTCTAGAGTTCATGGTTTAACCCTTGTACGTTTGTTTGCGATTCACTTGCAGATGTCTGAATAATTTAGCCACTTGAGTACTTCAATTACACTCCATTTTGGTAGATGCAACAAGTGAGTTAGTGGTTCATGTGCCCATCTTCGCCATCATGACAAC GCGGGGATTCTTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGGTTGGTGTAGGTTTTTGAAAGAAATGAAAATTGCGTACAGAGGGTTTCCGATATAAAGAAGGTGGGTGATGAGCAAGATGGAGAAGCAGGGCACGTGCATTACTAACTCATCATGAAGACCTAGAAAAGTTTTGCGTTAAGTAAACCTTGAAGGTGTTAATCCAACGTACCTAACCTAGCCAAATAGCCTTGAAGTCTAGAGTTCATGGTTTAACCCTTGTACGTTTGTTTGCGATTCACTTGCAGATGTCTGAATAATTTAGCCACTTGAGTACTTCAATTACACTCCATTTTGGTAGATGCAACAAGTGAGTTAGTGGTTCATGTGCCCATCTTCGCCATCATGACAACCCAACCTTTGTACAAGATTATAGCCGGCCAAGCTAGCTTAATTTATTCAGGTCAGTAATTAAGTTCATTAGCATGAATCTTCGAAAATGGCTGGCCTTGAACCTGATATTTTCATGGTAAACTAGTTATTTTGAAATTTGCAGCTTTTATGGAGTTATTTTTATAATTAATTGACAAAGTAAGTCGTTCTCTTAATTTCTTTATATATTGATGGAAATTAACAACTGATGTTTTATGACTGGAGGGGAAATCTACAGCTTGAAAATTTACTTTGTATAATTTCGTTATAGATGATAGCATATTTTATTTATGTGTCATGGGTTTTACCGAGCTCTTTTTGGCTTAGCTTTATATGAAGCTAAAAACAATACGGGAGGATGTG 4 0 5' arm Lactuca_virosa mirnest MIR164 0.000000000000001 ptc-MIR164e 7e-17 -70.9 ..((..((.(((((.((((..(((((((((.(((((((((((((..((...((((....(((.(((((.....))))).)))..))))(((.....)))(((.(((.((.............(((((((((.((((....((((.((...((((.((..(((((((((.....)))))))))..)).)))))).)))))))).)).)))))))..............))))).)))..)).))))))))))))).)))))))))..)))).))))).)).)).. (-70.9)