mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCTCCCTCAAGGGCTTCTAA AGAAGCTTCTTGATGGAGAATA TTTAAAAGGCAATGATTGTTTGTTCTCCCTCAAGGGCTTCTAATGTTGGTTGTATGATGCCCTTAATTTCAAGTGTATGTCTAGGATCATATAAGAAGCTTCTTGATGGAGAATAAAATTTCATTGTCTTTATT GCGGGGCTCTCCCTCAGGGCTTCTGCTTTTTTCCCCTACATGTCCTTAATCTTAAGGGTATGTTTAGGGTCATGTCAGAAGCCTTTTGATGGAGAATAAAAAATCAGTATCTTGATTGTGTTATTCAGTTGATGGCTTATAAAAAGTACTTGTCCACTAAGGTTTCATGGTTTTAAGACCAATGGGATAAGAGAAACTAAGAAAGGTTTAAAAGGCAATGATTGTTTGTTCTCCCTCAAGGGCTTCTAATGTTGGTTGTATGATGCCCTTAATTTCAAGTGTATGTCTAGGATCATATAAGAAGCTTCTTGATGGAGAATAAAATTTCATTGTCTTTATTTGTGTTAATGATACAAAAATGAAGATATTTAATGGTTTCTAATTTCATAATTTGGACAGCTACAAATCGATCGCCACCTTCTATGGACTTACTAGCCACTCCAAGTAGCCATGATCCATGTATTATGAACCAACTCATTTTGGCCACCTGTTTTCCACTCCAGTTGGCGATTTTTGGTTGAAATGGCCACGTGGTACGACAACCTGAGGTGGCAGCCAAGTATCTATTTGCCTTTGATGGGTATTCTTTAACTATGAGATTGTAGTTATTTTAAGGCTAGCCTTCCTCCCTCCCTTCATTCTATCTATTTCTTTGAAGACGAAGTTTTGTTTCTACATTTTGTTCTCTTGTAAGTGAGTTGTAACCCCCTTTTGTGTTAATTGGTATATACAAGTTACATGTTAATTGGTATATACAAGTTACATGTTTCACCCTGTTGATATACACAATCACCCTTGATTGTGAAATGATGTTAATACATGTGTCTCTTAAGTTTATTTGTTTGTAATTTATATATTTTATCTTGGTAT 2 1 5' arm Lactuca_virosa mirnest 100 aqc-MIR477g 0.00003 -44.9 ....(((((((((((...((((((((((.((((((((((((.((((.((((.((..((((.(((......))).))))...)).)))))))).)))))).)))))).))))))))))...)))))))))))... (-44.9)