mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACCTTTGGGGATATTCGTG CGAGTATCACCAAATGTCACT TAAGCGACAATAATTTGAGAGATAATATGTAACGAGTATCACCAAATGTCACTCTTTTAGATTTGTCTTATTAGTTAAGGAGTTGCAACTTATGAAGTAAATCAAAATAATATGATGACGAGCATAGTGGAAGGATAAATTAAAAGAGTGACCTTTGGGGATATTCGTGGCTCATTACTTCTCAAATTATTGCCACTC AACAATGAAAATGTATATGGTGGCGATCGAAAACCCCTAAAGAGATGAATGGCTATCATGCTTTGAGTGTTGTGAGTTCTAAACTTTTTCTGTGAATATATACACAAAATTCTCCTTACTTCTAGACATTTGAACTCAATAATTTTATTGGAACCAATTAAAAAGTTTTGGAAGTTTGTTTCTTAGTATCTTGTTTTGCATAGCAGTTCAATCAATGACAGCATTTCAATTGTGTTACTTAATTCTAAAATATTATTGCTAAGCGACAATAATTTGAGAGATAATATGTAACGAGTATCACCAAATGTCACTCTTTTAGATTTGTCTTATTAGTTAAGGAGTTGCAACTTATGAAGTAAATCAAAATAATATGATGACGAGCATAGTGGAAGGATAAATTAAAAGAGTGACCTTTGGGGATATTCGTGGCTCATTACTTCTCAAATTATTGCCACTCAACAATAATACTTTGGAATTAAGCAATACTTTTGAAATACTGTCATTGATTGAACTCTTATAATACTGTCATTGATTGAACTCTTATGCAAAATAAGATAATGAAAAACAAATTTCTAGAACTTGTCAATTGATTCTAATGGNAATTCTTGAGTTCAAAATGTTTAGAAGTGGTAGAGAGTTTTGTATATATATCCACTAAAAAAGTTTGAAACTCAATGCATTCAATATCAGAGTTCGAAGTTAAAAAGGAGGAATCCC 3 0 3' arm Arachis_hypogaea mirnest 100 ahy-MIR3518 3e-52 -61.5 .......((((((((((((((.((((..((.(((((((((.(((((.((((((((((((.(((((((((.((((((..........))).((((..((..((((........)))).))...)))).))).))))))))))))))))))))).))))).))))))))).))..)))).))))))))))))))...... (-61.5)