mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ACTCCCTCCGTTCCATAATAT ATTATGGGACGGAGGGAGTAC CCATAGTTCGTACTCCCTCCGTTCCATAATATAAGAACGTTTTTCAAGCTAACAAGCTTACAAAAATGCTCTTATATTATGGGACGGAGGGAGTACTTGGTTGT GCATTTTTTTTTTTTTTTTTTGGCAATAACAATTTTATCTTAGCAGTTGCAGCTTGTACAAGTAATCACAGGACAGGGCATCTGGCGCTAAAATAATTACCCGGCATAGTCGTCCCATTCAAATAACTGGAGATGAGATCCTACAAGGAAAATATTTGAGCGACAAGGTTTCAATCGGAGCCATAGTTCGTACTCCCTCCGTTCCATAATATAAGAACGTTTTTCAAGCTAACAAGCTTACAAAAATGCTCTTATATTATGGGACGGAGGGAGTACTTGGTTGTTGGCCATGTCAACTGCAAGAACCCATGCCTTTGGGTGCAGGAATTTGACCGTGATGATCAGGTAAACAACAGTTCCGCTCTGCAGCCTCACCGTTCAGGTTGAGAACAGGCTGACATGTCCAGAGATTCTGCAAGTTCCGCTCTGCAGCCTCACCGTTCTTCTGAGCCTCACGCAGCATTCCACAACGAAGCAGTCCAGACCGCATTGTTCTGTCAATTCTGGTGTCAGAAGCGTTGACAGTTCAGTCGATCTTCCAATCCTCCAGAGCATCAGTAACATTCCAGCTGGTGTATGTGCTGAGTACCCAGTTATCGATTCTCAACCTGGGGCCCCTGGTTTAAGGGTCTTTA 0 0 5' arm Leymus_cinereus_x_Leymus_triticoides mirnest MIR1122 7e-18 tae-MIR1120 0.00000000002 -52 .........(((((((((((((((((((((((((((.(((((((.(((((....)))))..))))))).)))))))))))))))))))))))))))........ (-52)