mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTTACTATGGCATCTGGTAA GCCAGGGCCATGAATGCAGA GAATCGAGCCGCCAGGGCCATGAATGCAGAACTGTTAAAGGAAAAAGAACAAACAATGTTACTATGGCATCTGGTAAAGCTTGC TGAGATTGTGCTAACATCTGCACATCTCACAGCATCCCAGTCGAGAGAATCCATGGTGTTCCATGTCTTCTCTCTCTTCCCTGCTATAGCTTGCGCGGCTGTTCGCAAGCTATCCCAGTTGATTTCGTCCTTTTGCTCTTTTCCTTTGCCCTTGCTGTCTTTTTTTGCTGAACTTGTCTCTCGGGCCTCATTGCTTGCTTCACTTTTGTGGGCACCAGCAGTTGCCTGTGCTGGAGCCACAATCCTTTGAGAGTGAGACCTTTGAGACATTTCAGCTCCGTTGTCTGGGCAGCAAGGCATGCTCTTTTCATTTTCTGAGCTGAGGACGGATTCCTGGGTTGGGAAGGTGGATGCTCTGAGGGGGACCTGAGTATTTTCTTTGGGGCTGCCATTCTTCAGGTCCCCAGATGTTAGCTTCTCAGTTGCTTCATCTCTTTTTGTGTCAGCTTCTTCCTGAACCTTGGTTGAATTTTCTGCCTGCTGGGTGATATTGACAGAAGTGTTCTTCTCCACTTCTGAGTGGCCCCCCGAACAGGATCCCATCTTCTCATCGTTCTGCCCATTTGAAGCTTCGCCAGTTTGGGAAACCCCAGAGCTTCGGGATGCCACCATATCATTAAACCCCGTTCTCTGAGTCATTTCTGGGACACTCCACTGTGTTATCTTGTGTCCAGAATGCTCAGTGGCGTCATGAACGGATGGATTCAACGGCGCATCCCCCTCTGAGATCTCTACTGGCGCCCCAACATTTACTTGTGATTTGTTGGGGAATCGAGCCGCCAGGGCCATGAATGCAGAACTGTTAAAGGAAAAAGAACAAACAATGTTACTATGGCATCTGGTAAAGCTTGCTTTCAAATGATACTGCAGAATACATACCTTGAGAGATGGTCTGAGACATTTTGGGTGAGGAAGACCCCCACCACCGAATCCACCACTGATCCTTTCCAGCGAGAGAAGCGTCTGTCTCCTGTTGTTGATTATGAGTCGTATAAATAGTGTTATGAGTGCAATTAGTGTACTAATGCTAAGCTCTTGTAAACTTTAAGTTCTTGTTTTTGTTATGTAATTTGGTTTTAATGTTAATTGTTGTTTGAATTTAATATTTTCCCTAAGTAAATTTGCAATCAGTTTATTTTCTTNNNAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 5 1 3' arm Arachis_hypogaea mirnest 100 ahy-MIR3511 6e-42 -22.3 ....(((((.((((((((((((...(((....((((...........)))).....)))...)))))).))))))...))))). (-22.3)