mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTGGGAATCTCTCTGATGCA CTTTGGATGATATTTCCAAGCC GGTGACTTGGTCTTGGGAATCTCTCTGATGCAATATCCTACACAAAACAACCGAAAAAAAAAAGAAGAGCAGAAAAGAGCTTAGTGATGCAAAGTTCTCATCTTCAAATCCTTTGTTTCACTGTGGATGGATTTTTGAATCTTAATTTCTTGTTTTGTTTAGACTTTGGATGATATTTCCAAGCCGTTGCTTG ATCAAAATCCTTGTGATTTGGTCCTCTATATTTTGAGTTTCTGATTTGATTAATTTGATGCAATGCCTATGATGGGTTTTAAATATACTTTAACTACTATGAAAAGGAACTCATCCGAGGCATTTGGGTTTTGTCTTTAACTGAAAGTATTGTATTTGGTATGTGTTTTTACTGCTTTGGTTGGTTACAAGTACTCTACTTTCCAGTAGAAGATGCCAAAAAATACAACTTCATTTTGGGCACTTCAAGTTGTACCAGAATGAGGTTATCTCAATTGAGTAGTTGAAGTGGAAAATCTAAAAGGGCTTGTAAAATTCTGAAAGTTTTGAGTAGATAGCATGCATTGGTCCTCATGGATTGATTCATTAATATTGTTTCCATTCTAAAAGATAGTTGCATAGGTTGACATATTTTCTACCATATAGTGACAAGTATGAATTACTCCATGGCTTAAAAAAAGGAACTGCAAGTGATGATAAACCAGACAGGGACATCAGCACTCCCCTCGGGAGGATGGTGACTTGGTCTTGGGAATCTCTCTGATGCAATATCCTACACAAAACAACCGAAAAAAAAAAGAAGAGCAGAAAAGAGCTTAGTGATGCAAAGTTCTCATCTTCAAATCCTTTGTTTCACTGTGGATGGATTTTTGAATCTTAATTTCTTGTTTTGTTTAGACTTTGGATGATATTTCCAAGCCGTTGCTTG 5 1 5' arm Liriodendron_tulipifera mirnest snoR44_J54 0.000003 vvi-MIR3630 0.0006 -44.8 ((((((..((.(((((((((.(((((((.........(((.(((((((((..((((........((((.((((((......((((((.((((((................)))))).))))))........))))))..))))..))))))))))))).)))...))))).)).))))))))))))))))).. (-44.8)