mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA GCGTATGAGGAGCCAAGCATA ATGTGTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGGAGAGCTCATCGAAACATCAATGATCTCTTTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTCCAT GAGGGTGCAATTCCAACCCCACATCTTCCTCCTTTCTCTCTGAAAACAAACCCTATTATTAGCCACACCTTAACTCGTCCTCTATGTGTTAGCCCACTGCTTTGCTTGTTTTATGCCAATTTTTCAGTTTGTGGGGCTCTCTCAAACCCCATTTATTTGATTATGACCTAGTTCTATTCTATAGATCTCCCTTCATCCTCACTATATACCTCCTCTCCTTCCCTCCCCCTTCACTCTTACTCTCTAGTACTACTCACTTTCTCTCCTTCATTCTCTTCCTCTCTCTTTTTTGTCCCTTACTCACTTCTTTCTTTCCCTACCACCAATTCCACCTTCATCTTCATACAACAATTATCATCTAGGTTTGATCACTTACATATATAGAAAGAATTTTTCTCACCACAAATCATGTGCATTACATTTATGTAGCCAAAGCTAGCTCTTTTGTTTTCACACACATATACACACACAAATTCTATAGCCTTTGGATGTGGGGAGAGATTTGTGGAGGCTAATTAGGAATTTGGAAGAGAAAATATTCATTTGATCTGAATATTTTTCTTCCTTTTTTAAATTTTGTTGCTATTCTAATTGTATTTAATTTATAGTCATATGTCATCATGCATACATATGTGTATGTGCCTGGCTCCCTGTATGCCATTTGGAGAGCTCATCGAAACATCAATGATCTCTTTGGATGGCGTATGAGGAGCCAAGCATATTCCATGTTTCATACATGGAGATGATCATGATCAAATTTAATTATCTACTTATGTTGAATGATCTAAATTGA 2 0 5' arm Lotus_japonicus mirnest mir-160 2e-42 gma-MIR160 7e-36 -46.4 ..(((.((((((.(((((((.((((((((((((((((((.((((.((....)).)))).)))))))))))))))))).))))))).))))))..))) (-46.4)