mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CCCGCCTTGCATCAACTGAAT ACTCTCTCGCTTCGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGCTGCTGCTTCTGCCGTTTTCGCGCGTAATCACTCACCGGAGGAGCGGTTACCGCCGCCGGTTGGATCGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAACCCGCCTTGAAGCTTTG GTTTGGGTTATCCTCGCGATTCTCCCAAACTTTCTCTCTCTCTAGCTTTCTCTCTCATCACAACGCTGTATGCGATTGATTGATTGATTCTTCACTCTCTCGCTTCGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACCGCTGCTGCTTCTGCCGTTTTCGCGCGTAATCACTCACCGGAGGAGCGGTTACCGCCGCCGGTTGGATCGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAACCCGCCTTGAAGCTTTGCCTCGTTTTCCGCTCAGATCTCATCTCCGAGTAAATTTTCAATTCCTGTTTATTAGATCCGAATTCATTCCTGTTTTTGCAGCTTATCGTCTCCATGGAAACCTCAATTATTGATATAGATCCTGATGCATAGCTTCCAAATCTAACGAAAATTGAGTGTTTACAATTAGATTTGATTTTCATTGATGTGTTTTCTGATATCGATTGAAATTCGAGATTCAATTCTTTCTTGAACATGGATTTTGATTCCAGTAATTGTGATTTTGTATCCATTGATAGCAGCTTAAGAAATATCTATAAGGTTCATACTGAATTGAGAAATAATGGTTATGATGAAGTTTAGCTCTGTGCTGAATTAGCCACAAGTGTTTGATGCTGACACATTTGATTTTGCTGCTTGTGCTGATTCTAGTTCATGCTATTTCTAGATTGTTTGATATTGCTTTTTGAACA 3 0 5' arm Lotus_japonicus mirnest MIR168 0.00000000000004 gma-MIR168 0.0000000000001 -60 ........(((((((((..(((.(((((.((((((((((.(((((.(((......((...((((.....(((.((((((.(((.......))).)))))))))...)))).))..))).))))).)))))))))).))))).)))..))))...))))).... (-60)