mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCACA TGCTCACTGCTCTCTCCGTCACC TTTTTTGTTTTCTGTTTTGGGACATAGAAATTGACAGAAGAGAGTGAGCACAGAGAGGCAAATTGTATAGGCATACACTATTGCTTTTGTGTGCTCACTGCTCTCTCCGTCACCTTCCAGTGCCGGAAGTTTGCTTCATTCT TTTTTGTTTCCTTGAGTTTTTTCCATGTTTGGTAGCTAGCAAACCCTAATAAAATCTCCATATTCATATATGTTCTCAGTTCTGATTATACTCATGAAGATGGTAGGTGAGTAGATCATAAATACTTGTTTTTTTTCCATTAATGGGTATCTCTCTCTTCCTTCCTTCAGATCTGATTTTTTCTCCAAAGTGAGATGCTCTTTTCCCTTTCCCAATTTGGGTGGTTTTTTGTTTTCTGTTTTGGGACATAGAAATTGACAGAAGAGAGTGAGCACAGAGAGGCAAATTGTATAGGCATACACTATTGCTTTTGTGTGCTCACTGCTCTCTCCGTCACCTTCCAGTGCCGGAAGTTTGCTTCATTCTGGCTCTGTTATCTTGTTCCAAACCCAAACCCCAGCCCACCTGAAACCTGAAACCTTTCTTTCTCTCTCGACTGACTCTCTGATGAAGGAGCTGAACAACACTGCAACACAGGTTATATCATTTCTTTATCGAACAGTGTAAGGCTGTCTCTACTGTTGCTTTGGCGCTTATTTTTTTCCATTTTTTTCTCTTTCAATTGATTTATATTATATTATATTCCAGTCATCAATACATTACTCATGATTCAATTTAACATTATCTATGCTCAGTTGTGGTGGTTATTGCAGTGGTTAAAAGTTGTCGTTTAAATCTATTTATGGTCGAAAGTT 1 2 5' arm Lotus_japonicus mirnest mir-156 0.000002 tcc-MIR156g 1e-25 -47.8 .(((((((.((((.....)))).))))))).((((.((((((((((((((((.((((((((..(((((....)))))...)))))))).)))))))))).)))).)).)))).(((((......)))))............. (-47.8)