mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG GATCATATGGCAGCTTCACC ATAAAGTCTCGGTTCGTGCACCTGCAATAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGAGCTTACCTTCTTGTAATAATGGTAAGAACAGATCATATGGCAGCTTCACCTGTTGAATGGAAGCATACAGACCCTAAT CCTTTGTTTATATAAAGTCTCGGTTCGTGCACCTGCAATAGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGAGCTTACCTTCTTGTAATAATGGTAAGAACAGATCATATGGCAGCTTCACCTGTTGAATGGAAGCATACAGACCCTAATCACCTTTCTCTCATCTTTGAAAAGATGAATTTCATTCGGCATCACACAGCCCTTTACAAAAGTTGAATTGCTGTGTTCTTCTGTTGGTCAAATCTGGAAATGGCACTCGATCCGTGGCAAAAAGAAAGAGGAGAGGGATCGTGGCATGTGTTCAGGATTTTCAATGCATCCTCTTGCCTTGGATATGAGGACAGTGTTTTTTACTTTTTAAGAACTTTTGTAAGTCACCTAAAACTTTTTTTCCCCATCTTTTTCTGTATCTTATGCTATCTTAATTCTTATGCATTGGTTTTCATTTGTACTAAAAAAAAAAAAAAAA 1 1 5' arm Lotus_japonicus mirnest MIR167_1 0.00000003 lja-MIR167 1e-56 -50.2 ..........((((.((((.((..((((((.(((((((((((..((((((((..((((((.............))))))..)))))))).))))))))))).))))))...))..))))...))))..... (-50.2)