mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGTCCAGATTCGTAGTACTAT AGTATTATGAATTTGGACATG TACTGCGTATATAGTATTATGAATTTGGACATGGGACTAGTCCAGATTCGTAGTACTATATGTCCAGG GGGGAATTCGGCATTACTGGCGGGGGAAACATACACTGCATCACGCAGCAGCAGCCTGTACGCCCGTCGTAGATGATACTGCGTATATAGTATTATGAATTTGGACATGGGACTAGTCCAGATTCGTAGTACTATATGTCCAGGAAGTAGATGGCACTATAGCAGCCATGCCCTATCGTGAATTCGTGATAAGCTACATCATTTGCTACCCAAAATGGCGCACCGATCATACACCATTGATTACCCAAAACCAAATGAATGAATTGATAGATTACCCACAAACAAATGAATGGGTTGATAGAATAAGGCCGCCAGACCAAAAAAAAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCACTCGAAGCGTGAAATTTGATAAATTCGGCTAACTAATGTAAAACAGACAATAATACCATAGGCCAATGGAAACCCTATAGACCAGCTGACGCCAAGTTACGTTGTACAAGGACAACACCTTTAAAACGTATCAGTAGGAAAACGTTACGGGGTACATA 1 0 3' arm Oryza_sativa mirnest MIR1122 0.000003 osa-MIR1862b 0.0007 -28.5 ..(((.((((((((((((((((((((((((.........)))))))))))))))))))))))).))). (-28.5)