mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAGGCATCGGTTCATCGAT CGATAAACCTTTGCATCCAGC GTGGGAGTGCACTGGAGGCATCGGTTCATCGATCTGTTTATGAGATTTTGTTGTGAGTAAACACAGTTCATGAATCGGTCGATAAACCTTTGCATCCAGCGCTCACTCT CCCCACCTCTCTCGTTTCTGAGATCTACGGGTGGTGGTTGACATGCATTTGTTTTGTTATTATTTTTTTTTTATAAAAATAATTACTTGGTGGGGTGGGAGTGCACTGGAGGCATCGGTTCATCGATCTGTTTATGAGATTTTGTTGTGAGTAAACACAGTTCATGAATCGGTCGATAAACCTTTGCATCCAGCGCTCACTCTCCCATTCTTCTCTTTATTTATTTTTAATTTTTTGCTGGTATTTCTGAACTTGTTCTGTTTGGTTGCTGACAAAGTGTGGGAAAATATGGTAAAGACTGAAGTTTTTGTGTTTTTTCCAACTTTT 4 0 5' arm Malus_domestica mirnest MIR162_2 0.000000000006 ghr-MIR162a 0.00000000000009 -42 ...(((((((.(((((.(((..((((.(((((((.(((((((((....((((.......))))...))))))))).))))))).))))..))).))))).))..))))) (-42)