mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACCAAAGAAGATTTGCCCCA GGGCAATTCTTGCTTTGGCAGT ATGTTTATGGGTATGCATTCCTGGGCAATTCTTGCTTTGGCAGTTGGCAACTCATGTTGTAATCAACTACAAAGAGTAGGCCTACTACCAAAGAAGATTTGCCCCACAATTCAGTCCATACAATT ACTGAACTATAAATTACTATTGAACCTTGAAACTGTTTCATCAGTACAAAGTTTAAGGGTACGCACCCTTATGTTTATGGGCACTGTTTCATCAGTACATAGTTTAAGGGTACGTACCCTTATGTTTATGGGTATGCATTCCTGGGCAATTCTTGCTTTGGCAGTTGGCAACTCATGTTGTAATCAACTACAAAGAGTAGGCCTACTACCAAAGAAGATTTGCCCCACAATTCAGTCCATACAATTCTCTCTCAAGCAATGCCTTTATTTTCAGCTTCTCTTGGAATTCTATGATAGTGTTAGTAAGTTCTAGTTGAATGATTTCTTTTTCATGCATGTGTATATATATTGATCACACGTGTGCATCTTATTACATTGATAAGCTAAACCCAATCCCATTGCATAATCCTGAAATATTTGAGTAAAAATGTTAATGGGTTTCAACGAAGGGCAAATTATTGCATGCTACAAAGGCCGTTGAAGTTCCGTACACAATATAAAAGTTCTGAATTTCGAGGCTCAAAAAGGAAATAATAATTAATGAGATGATTTTGA 4 1 3' arm Manihot_esculenta mirnest mir-399 0.000000007 ptc-MIR399e 0.00002 -42 .(((..(((((..((.(((...((((((.((((.((((((.(((.(((.((((...(((((......))))).))))..))).))).)))))))))).))))))...))).)).))))))))... (-42)