mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACGACGAGAGAGAGCACAC GTGCTCTCTGCCGTCGTCATA TATCTCGTTCTCTTGATTGCCTTAGCTTTGACATAATTGGTTGACGACGAGAGAGAGCACACTTGTTAGCATTCATGCTGTGGTCATGGGCGTCTATAAGTGTGCTCTCTGCCGTCGTCATACAATATGGTCAAAGAAGGTTTATCTTTACTGGCACATG GGGGGATGGATTGTCAAACAATCAGAAGGTACATAAGTGGAAAAACACTGACCAATCAAAGTTCCAACATGTAAACATAATTGTCAAAGGTTGAGCGATCAATCCCTTCTTCCATCATTATTCCTCTAAATCTTCCACTGCCAAGAGAAGCTCCTTTCTTTCCTTCTTTTACCCTACAAAAGGAGCCCATCTACTGTATTCTATTTGTTCTGTTCTGGCTATATCCTCCACTTCAGTTTTGCACTTTTTGGATCTATACAAGCCGTCCAGTGGTGCTTGCCGGTGTCGTCTTGTTTTATTTTTTGTGATATTGTATGTTTTTTCATCGGTGGTTTAGGTTTGAATCTGTGATTTTCTTCAACAAACTCGGGTTCAAGGTTGCTTTGAAAGATTCTGGTTATGAAGACTCAAAAGTTATTGGAATATCTCGTTCTCTTGATTGCCTTAGCTTTGACATAATTGGTTGACGACGAGAGAGAGCACACTTGTTAGCATTCATGCTGTGGTCATGGGCGTCTATAAGTGTGCTCTCTGCCGTCGTCATACAATATGGTCAAAGAAGGTTTATCTTTACTGGCACATGGCTGAGCAAGTGATTTTAACGGACGTCTTGCTGTAGCTGTATCTCA 2 0 5' arm Manihot_esculenta mirnest MIR535 0.000000002 rco-MIR535 0.0000001 -58.3 ......((.((...(((.(((((..(((((((...((((..((((((((..(((((((((((((((..((.(((((((....).)))))).))..)))))))))))))))..))))))))..))))...))))))))))))..)))......)).))... (-58.3)