mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCGCCTTGCATCAACTGAAT TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CGGCTGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTAGCTTCGCTTGCATATGTACGTATATGTTTTCTCCTTATTATGCTAGATGGCAAGTCTTGATTGGTTGAGATCGGACAGAAGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGCG GAAGGGCAGTGTGTATCCATAGACTTTCTCATTCTTTCTTCTTAATTCAATATCCATGTCTTTCAAAGCGAGAGATGGGGAAGTTGATTCTGTTACCGGCTGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTAGCTTCGCTTGCATATGTACGTATATGTTTTCTCCTTATTATGCTAGATGGCAAGTCTTGATTGGTTGAGATCGGACAGAAGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGCGGTGAAGGGTTGCATGGATCTCGCGTTTTATTTCCTTTTACTGTTCAGATCTCAGGTTGAGGCATTATTTATACATTTGTTTTTGTGATGAAGCTGTGGATTATAGCTGAAAAGTGAAAAGCTTCTGATTCATTACTTGAAAATGGAAGCTTTAATTATACTTGTTATGGGATTTTTGGGCGTTTGTTGATCTTTTATTATTTGGCATTAGTAGATCTAATTATTACAACTTCTAATTAGTCCTTCATTATTATGCTGGTGTTAGCCCCTTAATTCATATAATATAAATTGACTATATTTATAGCGCAAAAGATTTTATTTTTTACATGAGTCGATAAGAGGGATAACTTGTTCTCAATAGCTAGAATATTAGATCTAATTAAATAAA 2 0 3' arm Manihot_esculenta mirnest MIR168 4e-17 tcc-MIR168 4e-17 -63.7 ..((.((((((.(((((.((((((((((.(((((.((((((.(((((.((.(((((((....)))))))..((((...((((....((((.....))))....)))).))))..))...))))).)))))).))))).)))))))))).))))).)))))).)). (-63.7)