mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CCCGCCTTGCATCAACTGAAT CCGGCTGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTAGCTTCGCTTGCATATGTACGTATATGTTTTCTCCTTATTATGCTAGATGGCAAGTCTTGATTGGTTGAGATCGGACAGAAGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGCGG GAAGGGCAGTGTGTATCCATAGACTTTCTCATTCTTTCTTCTTAATTCAATATCCATGTCTTTCAAAGCGAGAGATGGGGAAGTTGATTCTGTTACCGGCTGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGATTAGCTTCGCTTGCATATGTACGTATATGTTTTCTCCTTATTATGCTAGATGGCAAGTCTTGATTGGTTGAGATCGGACAGAAGCGAATTGGATCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGAGACCGCGGTGAAGGGTTGCATGGATCTCGCGTTTTATTTCCTTTTACTGTTCAGATCTCAGGTTGAGGCATTATTTATACATTTGTTTTTGTGATGAAGCTGTGGATTATAGCTGAAAAGTGAAAAGCTTCTGATTCATTACTTGAAAATGGAAGCTTTAATTATACTTGTTATGGGATTTTTGGGCGTTTGTTGATCTTTTATTATTTGGCATTAGTAGATCTAATTATTACAACTTCTAATTAGTCCTTCATTATTATGCTGGTGTTAGCCCCTTAATTCATATAATATAAATTGACTATATTTATAGCGCAAAAGATTTTATTTTTTACATGAGTCGATAAGAGGGATAACTTGTTCTCAATAGCTAGAATATTAGATCTAATTAAATAAA 3 0 5' arm Manihot_esculenta mirnest MIR168 1e-17 tcc-MIR168 1e-17 -63.7 ...((.((((((.(((((.((((((((((.(((((.((((((.(((((.((.(((((((....)))))))..((((...((((....((((.....))))....)))).))))..))...))))).)))))).))))).)))))))))).))))).)))))).)).. (-63.7)