mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCC AATGTTGTCTGGCTCGAGG CTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTCTTTTGATGCTTTTACATACAGATCTAAGCATATTGATCAACTGCTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTAA GATCATTCCCTTCATCATCTCTTCATGATCACCAAAATCTCTCTCTCTCTCCCTCTCGCTCTCATCCCCCTTGAAGATAGGCGAGACTCTTGGGGGATACAGAGATAAGATCAATTTTCTCTGTTATGAATTCAACACCATATTCAAGGGAAGCTTCTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTCTTTTGATGCTTTTACATACAGATCTAAGCATATTGATCAACTGCTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTAATGCTTCCATACTGATTTTTCAAGACCTGCATGTAAAGGTTTGCTTTTCTATAATTAAATCTCTTTTTTCTTTTTCTCTAATTTGTTGTATTGGTCTTTTTTTGGGAAACATCGGCGGTTCTATATCATGGGTTTTCATTTTTAGGCTAATCAAGGTTGTTAGACCTTTGCAGAGTGGTGTAATGATGAAATATTTGACCATCCACTTTGAA 3 0 3' arm Manihot_esculenta mirnest mir-166 0.000000000000002 rco-MIR166e 0.000000000000002 -35.7 .....(((.((((((((..((((((.((((.(((...((.(((((((((..............)))))......)))).....)).))).)))).))))))..)))))))).))).... (-35.7)