mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATGTTGTCTGGCTCGAGG TCGGACCAGGCTTCATTCCCC TCTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTCTTTTGATGCTTTTACATACAGATCTAAGCATATTGATCAACTGCTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTAAT GATCATTCCCTTCATCATCTCTTCATGATCACCAAAATCTCTCTCTCTCTCCCTCTCGCTCTCATCCCCCTTGAAGATAGGCGAGACTCTTGGGGGATACAGAGATAAGATCAATTTTCTCTGTTATGAATTCAACACCATATTCAAGGGAAGCTTCTCTTTTGAGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGACTCTCTTTTGATGCTTTTACATACAGATCTAAGCATATTGATCAACTGCTAGTGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTAATGCTTCCATACTGATTTTTCAAGACCTGCATGTAAAGGTTTGCTTTTCTATAATTAAATCTCTTTTTTCTTTTTCTCTAATTTGTTGTATTGGTCTTTTTTTGGGAAACATCGGCGGTTCTATATCATGGGTTTTCATTTTTAGGCTAATCAAGGTTGTTAGACCTTTGCAGAGTGGTGTAATGATGAAATATTTGACCATCCACTTTGAA 4 0 5' arm Manihot_esculenta mirnest mir-166 0.000000000000002 rco-MIR166e 0.000000000000002 -35.7 ......(((.((((((((..((((((.((((.(((...((.(((((((((..............)))))......)))).....)).))).)))).))))))..)))))))).)))..... (-35.7)