mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCATCATCATCATCATCCTCA AGACATATGAGATGATGAAC TCGTCGTCTTCATCATCATCATCATCCTCATCATCACCTTCTAATAGCTATGTTGCCACTGTTGGTTCAACGGCTTCAACTTCTACACCGAGATGCTATCATCAAATCTCGAAGCCGGTAGCCTATCCTGTGAAGAAGATTCTTCCTCATCCTCACTATGTTTACCATGTCCCTGGAAACACTAGCCATGCCTNNNTGGTTCACAACGGAAATCATTGGCAATAGCTGCTGCGGAACTGAACTGAGACATATGAGATGATGAACCATAAA TCNNNCCTTCCCTTGACACCACCAAGCGCCACCTCAAACCGCCGTCCTCCTCCTCCACAACGTCCACCATCAAGTTCCTTTGCAGCTACGGCGGCAAGATCGTTCCTCGTTATCCTGACGGGAAACTCCGTTATCACGGTGGCGAGACCCGCGTCCTCTCCGTGGACCGCTCCATTTCCTTCTCTGGTTAGTCTTAGTTTATCATTTGTTCTTCTCAGTTTGTCAATTGTGTAAGATTAAATGCGTTTCGTGTTGTGTATATGGTGTGCGTGTGTTTGTGTTGACAAAGACGAATAACGTGTATTTTGTGAATTGATTTGATTATGAGTATGATTTGGAGTGGAATTATTGGCTGTGTGGTCTATACAGCGCTGTTGTTGAAGCTCGGGGAGTTGTGTGGGAAGGAAGTGAGTCTCCGTTGTCAGTTGCCAAATGAGGATGTAGACGCTCTGGTATCGATCACCTCGGATGAGGATCTGGTTAATCTCATCGAGGAATACGATCGAGCTGCAACCCCAAAGATCAGGGCCTTCCTATCTATGCCTAAAAAAATATCTCCTCCTCTTTCCTCGTCGTCGTCGTCTTCATCATCATCATCATCCTCATCATCACCTTCTAATAGCTATGTTGCCACTGTTGGTTCAACGGCTTCAACTTCTACACCGAGATGCTATCATCAAATCTCGAAGCCGGTAGCCTATCCTGTGAAGAAGATTCTTCCTCATCCTCACTATGTTTACCATGTCCCTGGAAACACTAGCCATGCCTNNNTGGTTCACAACGGAAATCATTGGCAATAGCTGCTGCGGAACTGAACTGAGACATATGAGATGATGAACCATAAATAGTAAAAGAAAAGGGAAAATACATTAAAAAAAAAAAAAAAAAATGC 4 1 5' arm Manihot_esculenta mirnest 100 100 -59.3 ........(((((((((.((((....((((...(((..((((..((((..((((((((.((..((((...(((((((............(((((...........))))))))))))..))))..((((((((.((.(((........))).)).((((((((.(((......)))))))).)))....(((.....))))))))..)))...)).))))))))...)))).)))).)))..))))....)))))))))))))....... (-59.3)