mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCTCAGCTTTCTTGAACTG GTTCAATAAAGCTGTGGGAAGA ATTATCAATACATATGGTCCTCTTTGTATTCTTCCTCAGCTTTCTTGAACTGCATCTTCCCTAATTTTTTTATCTTTTGTTTTTCCTCTCTCAGATCCAATTTTTTCTTTGGTAAATACTTATAATTTATCAAAAAAAAAAAAAGATGGATTTTTGGGAATTGAAAGATGGAAAATTTTAATTTGTGGGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAAATAGGCCCAACAAAAATTCAAGA CTCTTTCTCTCTCTACTTTTTTTTTCTCTGTTTCTCTCTCTACCCCTAACTAGGGTTTAGCCCCTTCCTTAGGTCGGGCCAAATACCTAATAGATACACATACATACCCAATCAAATCAAAATCCAAATTATCAATACATATGGTCCTCTTTGTATTCTTCCTCAGCTTTCTTGAACTGCATCTTCCCTAATTTTTTTATCTTTTGTTTTTCCTCTCTCAGATCCAATTTTTTCTTTGGTAAATACTTATAATTTATCAAAAAAAAAAAAAGATGGATTTTTGGGAATTGAAAGATGGAAAATTTTAATTTGTGGGTTGCGGTTCAATAAAGCTGTGGGAAGATACAAATAGGCCCAACAAAAATTCAAGATCCGCCCTTTTTTTTTGCTGATCGATGATGGCTCTCTTCTTCTATTATGGTTCCTAAGTCCATCTTTTTTTCAATATATTTTTATCTTTTTGATCGCTATTTATTTAGATTTATCTTTTTTTTTTTCACGTCTTTTTATTTTTCTTACCTCATCTTTGTGGGTCTAACCCTAGTGTCCATAAGGGAAAGGGAA 1 1 5' arm Mesembryanthemum_crystallinum mirnest MIR396 0.00000000006 lja-MIR396 0.0000000000009 -77.8 ..............(((.(((.(((((((.(((((((((((((.((((((((((....(((.((.((((((((((((((...(((((.....(((((((.((((((.((((((((((.......)))))))))).)))))).....)))))))..))))).)))))))))))))).))........))).)))))))))).))))))).))))))))))))).))).))).............. (-77.8)