mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTGGGATCAGGCAGAGCATGA ATGCACTGCCTCTTCCCTGGTT ATGTATTGATACTGGGATCAGGCAGAGCATGACTGGAGCTACCTATATACACATTTGTTCATTGAGTCACAGAAGGAAACACACACATATACATACACACTTAGATAAAGACATGATACATCATCTCATCTATTGTGTCTATTCTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGTTCTCTCTT CATAATCTGAAAAACCATATCAGAGATGAGACCCGGAAACTTAGACATCAGATGTATTGATACTGGGATCAGGCAGAGCATGACTGGAGCTACCTATATACACATTTGTTCATTGAGTCACAGAAGGAAACACACACATATACATACACACTTAGATAAAGACATGATACATCATCTCATCTATTGTGTCTATTCTCATGCACTGCCTCTTCCCTGGTTCTCTCTTTCTTTTTCCTTTTTTATTTATCTTTT 4 1 5' arm Arachis_ipaensis mirnest MIR408 0.00004 ahy-MIR408 0.000000009 -35.7 .......((.(((((((..((((((.(((((.(((..(((........(((....)))......)))..)))..((((...............((.((((.(((((...((.((((....)))).)))))))..)))).))))))))))).))))))..)))).)))..)).... (-35.7)