mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTCTCTCTCCATTTCTCTCT AGAAAAATGGCGGAACAAGG ACCCACACCCCTCTCTCTCTCCATTTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTATCCCTCTCTCATATAAGACCTTCGATCCTTCAAATTCTTCACCTCATTTCGTATAAAAACACTATCATTTTCAAATTCTTGGCGCTTTGATCTCTCATTTGAACACTATAAAGCTCTGAAAACCCCCTATTTTCCCCCAAATCAGCTGACCCAGAAAAGAGAAAACCCTAGATTTGGGTTTGGTAGGATTAGGGTGATTTCAAGAAGAGGGGGAGGGAGGTGATCCCAGATATATAGATAGAGAAAAATGGCGGAACAAGGCTTGGAAG GTTGCAACCCACACCCCTCTCTCTCTCCATTTCTCTCTCTCTCTCTCCTCTCTATCCCTCTCTCATATAAGACCTTCGATCCTTCAAATTCTTCACCTCATTTCGTATAAAAACACTATCATTTTCAAATTCTTGGCGCTTTGATCTCTCATTTGAACACTATAAAGCTCTGAAAACCCCCTATTTTCCCCCAAATCAGCTGACCCAGAAAAGAGAAAACCCTAGATTTGGGTTTGGTAGGATTAGGGTGATTTCAAGAAGAGGGGGAGGGAGGTGATCCCAGATATATAGATAGAGAAAAATGGCGGAACAAGGCTTGGAAGGAAGCCAGCCAGTGGATCCCATTAAGCACCCATCTGGGATCGTCCCGACGCTGCAGAATATTGTCTCAACTGTAAACTTGGACTGCAAATTGGATCTGAAAGCCATTGCACTGCAAGCTCGTAACGCAGAATATAACCCAAAGCGTTTTGCTGCCGTTATTATGAGGATAAGGGAGCCAAAGACCACTGCTTTAATATTTGCTTCCGGCAAAATGGTTTGTACGGGAGCTAAGAGTGAGCAACAATCAAAACTTGCAGCTCGTAAGTATGCTCGAATTATTCAGAAGCTGGGATTTCCTGCAAAATTTAAGGATTTCAAAATCCAGAACATAGTGGGATCTTGCGATGTCAAATTCCTATTAGACTGGAGGGGCTTGCGTATTCTCACGGG 5 1 5' arm Mesembryanthemum_crystallinum mirnest 100 100 -60.489 ..(((....(((...(((..((((((.(((((.((((...(((((((.(((((((.((...(((((..........................................................)))))..((((((.....((....))......))))))..(((((...(((((...(((.(((........((((((((....((......))...)))))))))))..))).)))))...))))).))))))))).))))))).)).............)).))))).)))))).)))...)))..)))... (-60.489)