mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCGATTTTGCTGACGTGGCAT GTCACGTTTCGGTATCATCGGGT GCCAGCGGCGTGTGTCACGTTTCGGTATCATCGGGTGCAGAACATTCTAGATCTGATGCGTCCCAGCTGGCCGTGAATGGAACAGCTCGTGAGGGTGTTGGAGGTTCTACACTGGCAGCTGGCCGGGCGCGGTATAACGCCGGTGCTATTGAAACTCACGTCTCGGGAACTAATGGTACAAATACGTTAAGCCGGCCAGCTGCGCGTGGACGTATCATCGGTCGGCTGCCTAATTCGCCTAGGCCTGGAACCTTCGAGATCAATGCAGCAGACGCTTATGTGGATGGCGTCGCTGTAACCGATTTTGCTGACGTGGCATCATCAGTGTT ACTGTTTGGACGCGGCACTGTGCGGTGAGCCTCATGAATCACTCAAGGTCACACGGAAAGGTCACACGGCACAACTGTGACTAATTGCCCGTGCACGCCCACGATGTCCAAGACGCTGCCATAATAGAACACTGATACTACAATAATTTGCGAACTAAACTAGCTGTTATGACCTCTGCTTAAAGTGTGCTAGCTGCACAGCTGCACATTATCTAAAACATCAGTTTACCTTTTTAATTCGGACAAGTTTGAAGTTTTTATTAGTAATTGGTATCCATCCCTTGTTGAAATCACAATTATGTACTGGCAGGCTTTGCTGCTGGCAATTGTCATTGCCAGCGGCGTGTGTCACGTTTCGGTATCATCGGGTGCAGAACATTCTAGATCTGATGCGTCCCAGCTGGCCGTGAATGGAACAGCTCGTGAGGGTGTTGGAGGTTCTACACTGGCAGCTGGCCGGGCGCGGTATAACGCCGGTGCTATTGAAACTCACGTCTCGGGAACTAATGGTACAAATACGTTAAGCCGGCCAGCTGCGCGTGGACGTATCATCGGTCGGCTGCCTAATTCGCCTAGGCCTGGAACCTTCGAGATCAATGCAGCAGACGCTTATGTGGATGGCGTCGCTGTAACCGATTTTGCTGACGTGGCATCATCAGTGTTATCGTTTCAAGAGCCGAACATTTCTCAAGACAACAAGATGTTACACACGGGGCAGACCCGTCGACATCTTCTGACGAGTGACTTAGGTACTTTCAATAACTTGATACTGNTGGTTCCTTGACATCTGCTTTCCATGCCTTTCTATCTGTATAATGTATAGGGTACTATCATCGGTTTTGTGTAAACAAGCTGATGACATTCGTGAAGCTGTCAATTTTATTCTCGTTATCATTGTAGCCTCAGCAGGACTCCGGCTTATACTTTTGAGGATAACCGAGTATTGGAGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 2 2 3' arm Mesostigma_viride mirnest 100 100 -113 (((...)))..((((((((..((((((..(((((....(((....))).(((((((....(((.((((((((((((.((((((.((((....)))).......))))))(((..((((((((((((.(.((((.....))))(((((((((...(((.......)))...))))))))).((....))..)))))))))))))..)))......))).)))))))))(((((.......)))))..)))....)).)))))..((((((.((((((.........)))))))))))).)))))..)))))))))))))).......... (-113)