mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCATTTGCACCTGCGCCTTC GGATGCATATGCCTATGCAGA TCTCTCTCTCACTCAAGATGTTGCTTTGATCTGCATTTGCACCTGCGCCTTCTTCTCTCTTAAATTCATCAAGAATTTGATGATTAATATGATGAATAAAAGAGGAATTTAAGGGGATGCATATGCCTATGCAGATGAATGCCACTTTTGGAAATAAAAATCA CACTCTCTCTCTCTCTCACTCAAGATGTTGCTTTGATCTGCATTTGCACCTGCGCCTTCTTCTCTCTTAAATTCATCAAGAATTTGATGATTAATATGATGAATAAAAGAGGAATTTAAGGGGATGCATATGCCTATGCAGATGAATGCCACTTTTGGAAATAAAAATCATACCCTTTCTCTCTCCTCCCTCTCTCTCTCTCTAAAAACAAGACATGTCCAGTGTCATTTTTTAGCTGGTGAGATCTCAATTGGCATCTTTCTTCTGCTTTTATAATTTCTATATATAACTATA 5 0 5' arm Mimulus_guttatus mirnest MIR530 0.0006 tcc-MIR530b 0.000002 -41.5 ............((((((.((.((.((.((((((((..(((..((((.((((((.((((((..((((((((..((((....))))....))))))))..)))))).....)))))).))))..)))..)))))))).)).)).))))))))............ (-41.5)