mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAAAGG TGGGTTGGAGGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAGGAGGGTCTTGGTTGGGTGGATTGAGCTGCTGGTTTATGGATTCCACTGCCCTATTCCATGTTTCCTTTCCTACAGCCGATGACAAAGATGGTGAATGTTTTGGGATAGGCTTGTGGTTTGCATAACTCAGGAGCTGCATCAACCCACCCTGACCTTTATTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTGTGTA GGAAGAAGAGGAGGAGGAGGGATGTGATGGGGACGCTTCGTTGCCCACCTCATTCGATCGACATATGCTTATCCTTCCCCTTGGTCTCTTCATCCGCTCGTACATATCGAATACTTGAACGCTTGTTGTTCTCATATGGATGTGCATGGATTTCGAGTGTGTTTCTTGTTTCTTTTGTGATGCTATTTTGTCTCAGGTTACGAGTTGTTCAGCTTAGAGAGTAGGAGGGATGTTTTTGGGTTGGAGGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAGGAGGGTCTTGGTTGGGTGGATTGAGCTGCTGGTTTATGGATTCCACTGCCCTATTCCATGTTTCCTTTCCTACAGCCGATGACAAAGATGGTGAATGTTTTGGGATAGGCTTGTGGTTTGCATAACTCAGGAGCTGCATCAACCCACCCTGACCTTTATTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTGTGTACTCCAACTTTCTGTTCTTGTTTTCATTTCTCTGTCTTGTTTCAGAATCACAACCCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTCCC 2 0 3' arm Musa_ABB_Group mirnest MIR159 2.0E-10 vvi-MIR159c 1.0E-11 -87.8 ......(((.((((((((((((..((((((((.(((((((..((.(((((.(((..((((.((((.(((((....((((.(((.(((((((...(((((.((...((.....)).....)).)).))).....))))))))))..))))....))))).)))).))))..))).))))).)).))))))).))))))))..)))))))))))).)))..... (-87.8)