mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGATTGAAGGGAGCTCTA GAGCTCCTTGAAGTCCAAAGA GGTTTGGGTTGGAGGTGGAGGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAGAAGGGACTTGGATGGGTGGACACAGCTGCTGGTTTATGGATTCCACTGCCCTATTCCATGTTTTGAGGACAAGGTTGATGGATGGTTTGGGATAGGCTTGTGGTTTGCATAACTCAGGAGCTGCATCAGCCCAGCCTGACCCTTATTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTATCTGTGGACTTCCA GGAGAAAGGGAGAGAGAGGTGGGGAGATGAAAAGAGCCGCTTTGCTTGGCACCCCTTCATCTTCATTTCTCTCATCGGTTGCTCATGGATTCATGGGTCCTTAGGCTGCTGCATGCCGAACCTCTGTTCACTTGTTGCCATATGTTGTTGGTTTATATGGCTGTACCATGTTGGATGTGGTTTGCAAGTAGTATTTTGTTTCTTGTTCTTTGCTGGACTGCTGCTTTCTGCTTATGTTTGCGAGTATTGATTGGGTGTGGAGTGGTTTGGGTTGGAGGTGGAGGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAAAGAAGGGACTTGGATGGGTGGACACAGCTGCTGGTTTATGGATTCCACTGCCCTATTCCATGTTTTGAGGACAAGGTTGATGGATGGTTTGGGATAGGCTTGTGGTTTGCATAACTCAGGAGCTGCATCAGCCCAGCCTGACCCTTATTTGGATTGAAGGGAGCTCTACATCTATCTGTGGACTTCCACTTTCTCTCCCTTGTTATGGGAAATTCTTCCTGTTTTTTTTTTTTTGATGGCTTTGTTATGTTCAAAAAA 2 0 3' arm Musa_ABB_Group mirnest MIR159 4.0E-12 vvi-MIR159c 2.0E-13 -90.5 ((...((.(((.(((((((.((((((((((((..((((((((.(((((....((.(((((.((..(((((.((((.(((((....((((.(((.(((((((...((((..(((...)))..)))).....))))))))))..))))....))))).)))).)))))..)).))))).))...))))).))))))))..)))))))))))).))))))).))).)).)). (-90.5)