mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATGTCGTTTGGCTCGAGG TCGGACCAGGCTTCATTCCCC AAGGAAAAAGGAAGCTTTTCTATTGTGGGGAATGTCGTTTGGCTCGAGGATTCTTCAATCTTGATCAAATTCTTACTTTTTTTATAGATCTGTATATCAATATATAGAGATCCATAATATTGAATTATGTTTTTGGTATCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAGATTGCTACCACTCACTCAT TGGGCCGACGTCGCATGGGCGCGCCTACTCCACTCTCTATCCCTTTCATCTTTCTCTCCTATCCCCCCTTAAAGAAAGGCGAGACTTTTGGGGGTTAAGGTACACCACAGTAAGAGACTATCACAAACACAACATATCTAAGGAAAAAGGAAGCTTTTCTATTGTGGGGAATGTCGTTTGGCTCGAGGATTCTTCAATCTTGATCAAATTCTTACTTTTTTTATAGATCTGTATATCAATATATAGAGATCCATAATATTGAATTATGTTTTTGGTATCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAGATTGCTACCACTCACTCATC 4 0 5' arm Nicotiana_benthamiana mirnest mir-166 0.00000005 ath-MIR165b 0.000000002 -49.3 .........((.(((...(((.(((.((((((((..((((((.((((.(((...((((....(((..(((((.........((((.(((((.(((((....))))).))))).))))....)))))..))).)))).))).)))).))))))..)))))))).))))))..))).)).......... (-49.3)