mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTCGTTTGGCTCGAGG AAAAGGAAGCTTTTCTATTGTGGGGAATGTCGTTTGGCTCGAGGATTCTTCAATCTTGATCAAATTCTTACTTTTTTTATAGATCTGTATATCAATATATAGAGATCCATAATATTGAATTATGTTTTTGGTATCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAGATTGCTACCACTCA TGGGCCGACGTCGCATGGGCGCGCCTACTCCACTCTCTATCCCTTTCATCTTTCTCTCCTATCCCCCCTTAAAGAAAGGCGAGACTTTTGGGGGTTAAGGTACACCACAGTAAGAGACTATCACAAACACAACATATCTAAGGAAAAAGGAAGCTTTTCTATTGTGGGGAATGTCGTTTGGCTCGAGGATTCTTCAATCTTGATCAAATTCTTACTTTTTTTATAGATCTGTATATCAATATATAGAGATCCATAATATTGAATTATGTTTTTGGTATCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAGATTGCTACCACTCACTCATC 3 0 3' arm Nicotiana_benthamiana mirnest mir-166 0.00000004 ath-MIR165b 0.000000002 -49.3 ....((.(((...(((.(((.((((((((..((((((.((((.(((...((((....(((..(((((.........((((.(((((.(((((....))))).))))).))))....)))))..))).)))).))).)))).))))))..)))))))).))))))..))).))..... (-49.3)