mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCC AATGTTGTCTGGCTCGAGG TTCTATTGTGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGAATCTTTAATCTTGATCAAATTCTTTACACAGATCTATCTATTATTATATATGTTGCTTATACATTTTAGATCTTATATAGATCTATAATTGTTAGTTGTTAGATCTATGAATTTTGATTATATTTTTTTGGGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAGAT GCGCCTACTCCACTCTCTCTCTTTCTTAATTTTTCCTTCTCCTCCCCCTAAAAGAAAGGCGAAAGTCTTGGGGGATAAAAAGATAAGAGAAAGAGAGGAAACTACACAAATAAGCAACAAAAATAAGACTCCTAACAATCAAGAAAGGGAGCTTTTCTATTGTGGGGAATGTTGTCTGGCTCGAGGAATCTTTAATCTTGATCAAATTCTTTACACAGATCTATCTATTATTATATATGTTGCTTATACATTTTAGATCTTATATAGATCTATAATTGTTAGTTGTTAGATCTATGAATTTTGATTATATTTTTTTGGGTCGTCGGACCAGGCTTCATTCCCCTCAAAGATTGCTGCCATATATTTGTACAATTAAGATCTTTTTTGGTTTATAATAAGGTGAGGCCCATGTTTAATTTCTTTTTATTTTATTTGTTTGTCAGTTATAAGTGCTATATTCAACATTTGGGACAAATTTGTACTTGTTTATTAACCTAATTTGGTATGTCCGTTATGTATCTGCAGATTGGTGTAATGATAAGGATCTTGACTTTAGTCTTTGAGTTCTGAAAAAAAAAGGGCGGCCGCCTGC 3 0 3' arm Nicotiana_benthamiana mirnest mir-166 0.0000008 aqc-MIR166e 0.000000003 -53.6 .(((.(((.((((((((..((((((.((((.((.((...((...((((((((....((.((.(((((((..................(((...(((...(((((((.....)))))))....))).)))...))))))).)))).))))))))....))...)).)).)))).))))))..)))))))).)))))). (-53.6)