mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATACTCCTTCCGTCCCAATTT ATTGGGACAGAGAGGGTGTTT GTGGTTGAACAATACTCCTTCCGTCCCAATTTATCTGGTACCGTTTGATCAGGCACAGAGTTTAAGAATGATTTTGTTTTTTTATAACTTGTGGTTTTAAACTGGCACTAGATATTTGTATGAGTGTTAATCAACTCATTGAGGGTAAAATGGAATTTTGAAGTTCAATTATTTCTAAATATAGAAAGATGATATTCTTTTTGTGACAGACCAAAAAGGAAAAATTGACACATAAATTGGGACAGAGAGGGTGTTTGAGATCAA CTCAATCCGTACGTGGAAGTGAACTATTGCGGTGGTGCTATCCAAAATTAGGGTTTGTGGAGCGCTAACAATCTCGATTTTCCTCTGTTTTTACTGATCTAATCATTATATTGGAGCTAATTAATCTGCTGCATATACAACGACGATATAAATCCAAATAGAGAAAAATGGTGGAGAGGAAGCTGTACAAAACGAAATTATGCTTGCTTTATCAAAGAGGCCGTTGTCATCGCCAGAGTTGTTCTTTCGGTCACGGCAATGCGCAGCTCCGTCGCTTCTCCGATTCCCCTGCCGCCGGTAATTTTGTTAGACTTCTCCATCACCACTTGTTTAACACTTTAACCATATTTTATTCATTCCATAAAGGTTGGAATTTTTTCCATTTTTATTGACTATTCTGTATGTGGTTGAACAATACTCCTTCCGTCCCAATTTATCTGGTACCGTTTGATCAGGCACAGAGTTTAAGAATGATTTTGTTTTTTTATAACTTGTGGTTTTAAACTGGCACTAGATATTTGTATGAGTGTTAATCAACTCATTGAGGGTAAAATGGAATTTTGAAGTTCAATTATTTCTAAATATAGAAAGATGATATTCTTTTTGTGACAGACCAAAAAGGAAAAATTGACACATAAATTGGGACAGAGAGGGTGTTTGAGATCAAGTTGAAAAAAGTGAGTCTTTGAAGTTGAAGAATATACTTGTTTCACTCAAAAGATATACACTTTGTAAGTTTAAAACAATCAAAAAAGTATACGGGTAAATCGTAATCAAGTATAATAAGCCCTAGAAGAGATTATTTAGCTAAGATCGTGATAGATCTCAAGGTTATGGAGAGTTTAAGTATCAAAGAGAGATAGAGAGAATTATATTTTAGGAGACCTTTCTCGAAATAATCAAAAGAAAAGTAC 2 0 5' arm Nicotiana_benthamiana mirnest 100 100 -61 .(((((....(((((((.(((.(((((((((((((((((.((((((((.....((((.((((.(((((((....)))))))....))))))))...)))))).)).))))))(((....))).((((((((....((.((...(((...((((((....(((..(((....((((((....))))))..)))..))).)))))).....)))...)).))...)))))))).))))))))))).))).)))))))...))))). (-61)