mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCTGGGATTACAGGTGTGAGC TCATTTTTGTATTTTTAGTAG ACCACATGTGGCTCATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGCTGACCAGGCGGGTCTTGAACTCTTGACCTCGTGATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACTCC CCCTCATGCGGCGCTCTGCTCAGCCTCCCGAGTACCTGGGACTATAGGCGCGTGCCACCACATGTGGCTCATTTTTGTATTTTTAGTAGAGATGGAGTTTCACCATGCTGACCAGGCGGGTCTTGAACTCTTGACCTCGTGATCCCCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGTGTGAGCCACCACTCCTGGCCTTGATTTTCTATTTTTATTTTTTCATGTTTCTTTACAATTTTAATCTATATGTCTCATCGAAATATTTAAAACCATGAAATAAAATACATCTGTCATAATGTTAACAGTAACTTCCCAATATATTCAAATTAAAAAACATTTATTTTAGACAGAAATACATGTTTATGTTTAGAAAAAGGGAACTTGCCTTTTTGAGATCAATAAATACCCATTTGAAGTAAAATTTGGCAATATATAAATTAATAGTGTGTTATTATGATACACAAAATTACCAAATTATAATTTCTTTCA 2 0 3' arm Nicotiana_tabacum mirnest Metazoa_SRP 5e-38 hsa-mir-3929 0.0000000000005 -45 .......(((((((((.((((((.((((((((.....((((.........(((((.((((.(((((.(((..........))).))))).))))..))))))))).....)))))))).)))))).)))))))))...... (-45)