mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCGCTCTGATACCATATTGAA TGATTGATATTGGGTGGCA GAAAATTCTTTTTGATTGATATTGGGTGGCAATGAGACTCGAACCCAAGACCTCTGTCCGCTCTGATACCATATTGAAATATGCAAC TATTTTATGAGTTTTTGATGAATAATCGATGTCACAACAATTTGTCAGGTGCTCAAATACTCTTACATCTACATATGGTCAGCTTTTTCACAGTTTGTCATGTTCATTTTTAACTCCTGTGTGTGTCCCTTACATCATTACATTATCATTAATTGTTGGAATTGATGTCAGTTTAAGTTTTAATCATCTCATCTAAAAGCTTAAGCTGTTGGAGAAAATACAATTTTATTTACTTAATTATATCTTCAACACGCCCTCAGTTGCAGGCTTGATTTTTTTTATGAGTCAAGCACGTGAAAATTCTTTTTGATTGATATTGGGTGGCAATGAGACTCGAACCCAAGACCTCTGTCCGCTCTGATACCATATTGAAATATGCAACCATTTCATCTAAAAGGTTAAGCTGTTAGAGAGAAAACACTTTTATTTACTTAATTATGTCTTCAACAGTGTCGTAACGCGACCATTGATTTGTCTCATCGGATCAGCATATCAGTGAGTGAGAAAAGTAACTAGAGCTACTTCGA 1 2 3' arm Nicotiana_tabacum mirnest 100 100 -13.1 .........(((((((((.(((((((((((...(((..((........)).))).).)))).)))))).)).)))))))........ (-13.1)