mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGCCGGGGGACGGACTGGGAA CCCAGTCCCGAACCCGTCGG TCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCCCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGTTCCTTCGGGGGCCTT TCCCGGGATCTTCGGGAAAAGGATTGGCTCTGAGGGCTGGGCACGGGGGTCCCAGTCCCGAACCCGTCGGCTGTCGGTGGACTGCTCGAGCTGCTCCCGCGGCGAGAGCGGGTCGCCGCGTGCCGGCCGGGGGACGGACTGGGAACGGTTCCTTCGGGGGCCTTCCCCGGGCGTCGAACAGCCAACTCAGAACTGGTACGGACAAGGGGAATCCGACTGTTTAATTAAAACAAAGCATTGCGATGGTCCCTGCGGATGTTTACGCAATGTGATTTCTGCCCAGTGCTCTGAATGTCAAAGTGAAGAAATTCAACCAAGCGCGGGTAAACGGCGGGAGTAACTATGACTCTCTTAAGGTAGCCAAATGCCTCGTCATCTAATTAGTGACGCGCATGAATGGATTAACGAGATTCCCACTGTCCCTGTCTACTATCCAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCTTGGCAGAATCAGCGGGGAAAGAAGACCCTGTTGAGCTTGACTCTAGTCCGACTTTGTGAAATGACTTGAGAGGTGTAGTATAAGTGGGAGCCGAAAGGCGAAAGTGAAATACCACTACTTTTAACGTTATTTTACTTATTCCGTGAATCGGAAGCGGGGCACTGCCCCTCTTTTTGGACCCAAGGCTTGCTTGCAGGCCGATCCGGGCGGAAGACATTGTCACGTGGGGAGTTTGGCTGGGGCGGCACATCTGTTAAAGATAACGCACGTGTCCTAAGATGAGCTCAACGAGACAGAAATCTCGTGTGCACAGATGGTAAAAGCTCGTTTGATTCTGATTTCAGTACGATACGAGCGTGAAAGCGTGCCTACGATCTTTAGACTCGATCGAAGCTAGAGTGTCAGAAAGTACCCAGGGATACTGCTGTGCAGC 5 1 3' arm Nicotiana_tabacum mirnest 100 peu-MIR2911 1e-41 -71.8 ((((...((...)).))))..(((((((((....(((((((((((.((((((.((((((..(((((....)))))..)))))).)))))))).))))).))))....)))))))))..((((((....)))))).. (-71.8)