mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CCCGCCTTGCATCAACTGAAT TCGCTTGGTGCAGGTCGGGAA CCATTTGTTGCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGACTCACCGGTGACGCTGTCCGCGCCGGAATCGGTGGCGTTAGTTTCGTTGATATTTTGTTTGTATTTATCGATATTTAGAGAGCTCTCTTTAGGACTTATTTGTTAGTAATTTGTTTTGTTGAAATTAACTTGATGTATGTGTAGATAAGTAGAGAGTGTTTACCCCCGGTTGGTTAAGTAATAGATATGAAGAGAGTTCATTTTTTTTTTTGTTTTTAATAAATTAGTTATGTATGAAAGTGCGCCTCGTCTATGGCTTATGTTTGTTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGTGACCGCGGTGAATTTGA ACAGGTACCCCTCATGCGGCCGCTGGAGGAGTCCATTTGTTGCGGCGGTCTCTAATTCGCTTGGTGCAGGTCGGGAACTGACTCACCGGTGACGCTGTCCGCGCCGGAATCGGTGGCGTTAGTTTCGTTGATATTTTGTTTGTATTTATCGATATTTAGAGAGCTCTCTTTAGGACTTATTTGTTAGTAATTTGTTTTGTTGAAATTAACTTGATGTATGTGTAGATAAGTAGAGAGTGTTTACCCCCGGTTGGTTAAGTAATAGATATGAAGAGAGTTCATTTTTTTTTTTGTTTTTAATAAATTAGTTATGTATGAAAGTGCGCCTCGTCTATGGCTTATGTTTGTTCCCGCCTTGCATCAACTGAATCGGTGACCGCGGTGAATTTGATTATGTTTGGATCGATCTATTCTCTCGCTACATGAGGTTTGTTTTTCATTCATTTTGATTCAAATATTTGCATAT 2 0 3' arm Nicotiana_tabacum mirnest MIR168 0.0000000000001 crt-MIR168 0.000000000000005 -96.1 .((....((((.((((((.((.(((((.((((((((((.(((((((.((((.(((((.((((((.((.((((((.......)))))).(((.(((..(((((.......)))))...))).)))((((((....))))))..((((((((((..(((..(((....((((....)))).)))..)))..)))))))))).)).)))))).....))))).)))).((.((((((...(((((((.....))))))).)))))).))...((((.(((((((.((((.........)))).)))))))...))))))))))).)))))))))).))))).)).)))))).))))...)). (-96.1)