mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCACA TGCTCACTTCTCTTGCTGTCACC TCAGATGTATGGTAATGTTTGTGGTTGGGAGAGAAGCAAATAAGAGAAGGGGGGACAAGGAGAATCAAGACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCAGGCAATTGTATAAAGATGTATACACACTGTCATTTGCGTGTGCTCACTTCTCTTGCTGTCACCTCTCTCTATATACTTTCCCCCATTTTATTCGGTTTGCTTTGCTTCCACCACTCAAACCACTTACACTT GAATGGGGTTTTGTGTATGTTCTGTCCACTGCATGTACCTAGAAAAAAACACATCATACTGAGAGAAAAAAAAAAGTAAAAGATCTTTTTCCTTTCTACTACTACTAGTACTAGAGTTTAGGGTGTGATGTATTCCAACACAACTCAGATATACTCATAAAACCCTAATTGTATCTCCTGCTAACATAACGGGTAGCGGGTAGCAGGTAGCAGATTCAGAATTTAGACGCTGTGAGTTTTAAGTCAGTAGATGTATGTTCTAGGTTTTTTCCATAAAAGGGGTTTGTGTTTTGGTTTTAGATCTGACTTCAGCAACACAATTCAGATGTATGGTAATGTTTGTGGTTGGGAGAGAAGCAAATAAGAGAAGGGGGGACAAGGAGAATCAAGACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCAGGCAATTGTATAAAGATGTATACACACTGTCATTTGCGTGTGCTCACTTCTCTTGCTGTCACCTCTCTCTATATACTTTCCCCCATTTTATTCGGTTTGCTTTGCTTCCACCACTCAAACCACTTACACTT 0 2 5' arm Nicotiana_tabacum mirnest mir-156 0.0000000000009 tcc-MIR156c 8e-16 -86.9 .....((((((((..((...(((((.(((((.(((((((((..(((...((((((.(((.(((....(((.(((((((((((((((((((((((((((((..((((((......))))))...))))...))))))))))))).)))))).))))))..))).))).....)))))))))......))).))))))))).)))))))))).)).))))..))))... (-86.9)