mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAAGCTGCCAGCATGATCTG AGTCATCTAGCAGCTTCAAT GTATATATTTGTATGTTGGTTTTTGAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTACGAACAAAGTCCATTTCTTTCTATATATAAATATTTTCTTGCAAAGAAGAAAAGAAAAGAAAGTCCATTTTTTCTTAAAATTTTGAGGTCTTTTAATTTCCTGTTTTGGGTTTGAAATTGAAGTGATATTTTCGAAAAGAAAATGGAATTTTTCGAAGTTTTCTTGAAAGAAAATATAGGTATCGTCTTTCATAGGTTTGGTTCCATCAAGTCATCTAGCAGCTTCAATCACTCACCAACAATACAGAAACAAATTA GATTATGAGAGCAAATCATACTTTCAAACTCAAAACTCACAACGTTTAGAAGTTAAATCCGCCACTGAAATTAATCATTAAAAGCCTCTAGTGACAAGAATGCAGAAGGGGAGGAAAAGGAAAAAGTAAAGAGAGGGGTATATATATATATATAGGAGTAGTAGATGGAAGGGAGATTCACGAGGGACATCCATCCATTTTCTGCAAAACCCAAAGCATGCATGCTTCTTGTGTGTGTGTGTGTGTTAATTTTGTGTTGCATCAGCCATAGGGCATCAATAACACACACACACACCAAAAGTCCCACTTCCTTCTTATACCTTAAAATGCTTCCTCAAATAGACTATTACCCTTTCTTCATTATTTGCTCTTTCTTGAATCCATTCTTGTTATATAGTACTATAAGTATATATTTGTATGTTGGTTTTTGAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTACGAACAAAGTCCATTTCTTTCTATATATAAATATTTTCTTGCAAAGAAGAAAAGAAAAGAAAGTCCATTTTTTCTTAAAATTTTGAGGTCTTTTAATTTCCTGTTTTGGGTTTGAAATTGAAGTGATATTTTCGAAAAGAAAATGGAATTTTTCGAAGTTTTCTTGAAAGAAAATATAGGTATCGTCTTTCATAGGTTTGGTTCCATCAAGTCATCTAGCAGCTTCAATCACTCACCAACAATACAGAAACAAATTAAATTAAAAGGCTTCATTTGAGCTTGACTTCTCAAGGATATATTAGTCAAGACATTGATTTATCTCAGGTAATTCTGTATCTTTATTTTTACTTTAGATTATCTTCTTAA 2 1 5' arm Nicotiana_tabacum mirnest MIR167_1 0.00000000008 gma-MIR167c 0.000000000004 -80.8 .......(((((((((((((....(((.((((((((((((.((.(((((.((((..((((..((.((............((((..((((((((((...(((((((...((((((....((((((((((.(((((((.(((...((((((((...(((.....))).))))))..))..))).)))))..)).)))))))))).))))))....)))))))..))))))))))..))))...........)).)).)))).)))).))))))).)))))))))))).))))))))).)))))))......... (-80.8)