mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGCTCTCTATGCTTCCGTCA ACAGAAGATAGAGAGCACAG AGATTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATCATGTCTGCTAAATCTGGGATTGGAGAGGGCACTGAATCAATTAAACTGCAGAGAATAAAAAGCATCTCAATTCATTTGTGCTCTCTATGCTTCCGTCATCACCT GAAAAATCTTGCCCTTCATTTATGCTTGTTCGTGATAAAAGAATAAAACATCAACTACTATATTTGCTGCTTTTGCTTTCCAGCAAGCTCTTTTCTGTGACATAGAATCAAAAGCGATGCATGATTTAACTTCTATGCGCATAATTATTATTTGGATTATAGGTTCAGACCTATTATTTGTTACAATTTGAATAGAAGTTTTACATATCAATTTATGAAGTATCAAGGTCAAATGAACCGGTACTGGGCGCTAATTCATACATTTGTATGGAAGAAGGGCAAGAGTCGGGTGTGAGATTGTTGACAGAAGATAGAGAGCACAGATGATGATCATGTCTGCTAAATCTGGGATTGGAGAGGGCACTGAATCAATTAAACTGCAGAGAATAAAAAGCATCTCAATTCATTTGTGCTCTCTATGCTTCCGTCATCACCTTCACCGCGTCTTGCGCCTCTCTTTCTTCCATTNCTTCTAAATTATCTCCGTATCTCATAATTTAGGTTTTCTTATGGGGATATTTCTTGCAAAAACAAACTTCTATAAAAGAAAAGAAATTGGAAGGTGGGGTCATGATTCACATAACCGAGTGCTACTTTTGCAGTCCTCTTTGTNGTGCAGGTTTGGCAGATTACAAGAAGAACTGAGGATTAATAGGTTTATGTATTCACAAGATTAGGCTAGCTAGAATAATGTCAGAATGTGGG 1 1 3' arm Nicotiana_tabacum mirnest 100 sly-MIR156a 0.000000000000008 -41.7 ....((.((((.((((((((((((((((((((((((((((((((.((.((((...))))..)).))))).)).))))..(.....)..((((..........))))...))))))))))))))))).)))).)))).))... (-41.7)