mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCAAAGGGATCGCATTGATC TCATGCGATCTCTTCGGATT TGGTGGAGTATTCCAAAGGGATCGCATTGATCCTGTGTCCCAATTTGAGTCCAATGGGATCATGCGATCTCTTCGGATTTCTCCATA TGCGGCCGCTAACACACAAAAATTGCATGAACAGTAACATTCAAACAAAAGGGTTGCACGAGGTTCGTGCATTCTCCTTTGTTTCCAAAAATCCTATAAATATAAAACCTCACCAGATGGAATCATATATCAGTACTCCCACTGAAGTGCCCGATAAATTATAGTTGGCCAGCTTTTAACGTGAATATATATGCAATTTCATAGCGCTGGTGGAGTATTCCAAAGGGATCGCATTGATCCTGTGTCCCAATTTGAGTCCAATGGGATCATGCGATCTCTTCGGATTTCTCCATATTACTGGCTCTAAACCTAAAATCCATGCCCACCATAGTGATCCAGGAGTCCCGTGTAAAGGGCGAGCGTGCACTCTAAGGTCTCGCTCTTCTTCAAGGTTTTCCAGTCAAGTAAAATAAGCTTCAATGTAGTGCTCACCTTCAAATGCCAGCAGGATTTGTTAAAAGAGTGATTAACGATCTCTT 1 1 5' arm Nicotiana_tabacum mirnest 100 ptc-MIR393d 0.0000003 -39.1 ..((((((...(((.((((((((((((.((((((((.................)))))))))))))))))))).)))...)))))). (-39.1)