mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTGAGTGCAGCGTTGATGA ATCTACGCTGCACTCAATCA GAAGGAGTAGCTATGCAGAGTGCTTAGAAATATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAAAATGTCGAATTTCTGCAGATACTGATGCTGCATTATTATTCATTTCAGACAGTTTTCATCTACGCTGCACTCAATCATGTTTCAGCGCTCTGAAGAAATAGTTAGTTT GAGAAAGCTAGGAAGGAGTAGCTATGCAGAGTGCTTAGAAATATCATTGAGTGCAGCGTTGATGAAAATGTCGAATTTCTGCAGATACTGATGCTGCATTATTATTCATTTCAGACAGTTTTCATCTACGCTGCACTCAATCATGTTTCAGCGCTCTGAAGAAATAGTTAGTTTACCCTAAACAGTCCCACACTCTTCTGTTGTGTACCTCATAAGTTCAGACCTCGAGTTTAACATCTTTTTCTGTAGGGTTAGCAAATCATGGTTCAAAACTCGATGGATAATGAACTCACATATCTATCCTTCTCAAGTTGAATACAAGACTTTAGTTTGAGGCAGAATTTGAACCTGTAACGTGCACCAAGCCCACACATCATGTGTTGCACCTCGAGTCTGTTATTTCATGCCCAATCCAATCAATGGAAAAATATGCAATCCTCTCCAGTGACAAATTAACCATTACCCACGATCAGACGACAAGCACAGGTTCATGGCCATGTCAAAACACT 1 0 5' arm Nicotiana_tabacum mirnest MIR397 0.0000006 sly-MIR397 0.00000003 -64.7 ....((.(((((((.(((((((((..(((((((.((((((((((((((.(((((((((((((((....(((((.........)))))...........))).)))).)))))))).)))))))))))))).)))))))))))))))).....))))))).)). (-64.7)