mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC CGCTGTCTATCCTGAGCATTA CAGCAGCAATGAGAAGCTCTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCTAACAGTGATTTGGAAACTGTATATATATGTATATATATGGTGAAGCATGAGCATGGGTGGCGCTGTCTATCCTGAGCATTATGGTTTCTTACTTGCTTT AGCAAGAGTGCGATAAAAAAGAAGAGCAGCAGCAATGAGAAGCTCTAAAGCTCAGGAGGGATAGCGCCTAACAGTGATTTGGAAACTGTATATATATGTATATATATGGTGAAGCATGAGCATGGGTGGCGCTGTCTATCCTGAGCATTATGGTTTCTTACTTGCTTTGTTTGCATCCTGCTGTGAAAGGCTACTTCCCACCTGCACTGCACTTTTGAATGGTGGATT 2 0 5' arm Nuphar_advena mirnest MIR390 0.00003 tcc-MIR390b 0.000002 -58 ....((((((((((((((.(((.((((((((.((((((((((..((.(((.((((...(((((((((((....)))))))))))......)))))))..)))))))))))).)))))))).))).))))))))).))))).. (-58)