mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGATGATGAGGCCACTCCATC TGTGGTGGCATCATCCTCGGC TACAGTCTGGTAGTCTTCCCCGAAACAAATTCTGTGGTGGCATCATCCTCGGCATAGTATTGTTCTGTGTTGCTACAACACCACAACCGATTGGCGAACCAAAAAGATTTGTCACTGCTGATGATGAGGCCACTCCATCACTCCCACCAGATTGTCGACTTCTGATAT TTTTTTTTTAAATACAAATAGTGCACAAAGGCCAATTGGCTTTTAACAAATGTCAGCAATAAATAAAACATAATCTACCCCTTAAGCAGAAATAGAGTGATACAAAAAAGGTGGACCGTGGACATAAAAATTATGTCATCAACACAAAGAACTGTGTGTATTCAGGTCCACCTGCACCTGAAATCTCTATGTATAGATCCTTGCATTGTCCTTGAAGTAATGGTACCCTCAGTTAAGTGGAACCGCGACTAGCTAGCACCGGCCCCAGGGTTCGATGTGGCGCTGCAAGGATGCTGTGGCTGTTGAACAAAACCACCACCAGTTCTTGCATAATTACTTTGTGACAGTCCACCAAAAGTATGGCCATTCGAGGTCGAGGCCTGACTTTGAAACGCATTCCCCCTCAAATTGCTCAATCTCGGAGAAAGGGAAGGTATGTTACAGTCTGGTAGTCTTCCCCGAAACAAATTCTGTGGTGGCATCATCCTCGGCATAGTATTGTTCTGTGTTGCTACAACACCACAACCGATTGGCGAACCAAAAAGATTTGTCACTGCTGATGATGAGGCCACTCCATCACTCCCACCAGATTGTCGACTTCTGATATTAAGAAATGCATGTATCACTCGCTGTATACGGCGTCTGTCTTGTAGAGTGAATGCCCGAGATCCAGAGGCAGTTGGAGTGGGTGGTTGAGACTGACCAGTCACTTGAGACAATGGAGTCTCAGGAATGTATGCCTCGTTAATATTGTTCTGTGTTGCTACAACACCACGACCGATTGGTGAACCAAAAAGATTTGTCGCTGCTGATGCTGAGGCCACTCCATCACTCCAACCATA 5 0 3' arm Ocimum_basilicum mirnest 100 100 -42.9 .(((((((((((((.......(((.....)))((.((((((.(((((.((((((..((.((((...((((((...)))))).))))...))(((((((.........))))))).)))))).))))).)))))).))..)))...))))))))))............. (-42.9)