mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AATGGGACGGAGGGAGTACAA TTACTCCCTCCGTCCCGCGAG CCCACTTTATTTATTACTCCCTCCGTCCCGCGAGAATTGTCCCAAAACTTTTAGGCGCGGGTATCAAGGAAAAAGAAAATTAGTGGTGTGAGTGGGTGGAGGAGTGAGGTTGATGAATTCTAACCACTAAATCCTTTCCATTTTTGGTAATGGGACTAATAAATGGGAAAGACCAAAAAGGAAAGTGGGACAATTTAAATGGGACGGAGGGAGTACAATTCTAGAAAA ATCCTTGTATCTCTCAATAGCTAACTCTCTAATTTCGATAGATTACATACAGCGGTCAGCGGGCAACATTTGGCCAATGTAGCCCACTTTATTTATTACTCCCTCCGTCCCGCGAGAATTGTCCCAAAACTTTTAGGCGCGGGTATCAAGGAAAAAGAAAATTAGTGGTGTGAGTGGGTGGAGGAGTGAGGTTGATGAATTCTAACCACTAAATCCTTTCCATTTTTGGTAATGGGACTAATAAATGGGAAAGACCAAAAAGGAAAGTGGGACAATTTAAATGGGACGGAGGGAGTACAATTCTAGAAAAAAAAAAAAAAGCTAACAATTTAGATTCATACTTGTTGTATTTCTTGAGAACAAACTTTTACATTCAGCCTCTTCAAATCCAAGTAGCTGATAATCATCGAATCCATTTTAGTCCATATAGAAATGGGAACAACGTAGCCAAAGCACGGGAAAGCATTGACGGGCTGAAAAGAAAAAAATGATGGCAACAAAATGGCGCAGCGACGACCCAACGACCGCAGCCAGAACGTCATCGTATCATCGGAGGCAAGACGACGTCGGCAAGTAGCGGCGACA 5 0 3' arm Ocimum_basilicum mirnest 100 osa-MIR812h 0.00005 -70.8 ..............((((((((((((((((...(((((((((((...(((((.(((((...(((((..((.........))..)))))...)))(((((.(((((...........)))))..)))))...((.((((((((((((((......))))).))))))))).)))).))))).....)))))))))))...))))))))))))))))............. (-70.8)