mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCCTGGCTCCTTGTATGCCA GCATGCTCGGAGCCATGCATG CTGTTTTGAAGGTATGTTTGTGTGCCTGGCTCCTTGTATGCCATTCGTGGAGTCTATCCATGCGCGGCCAGCCTTCGTGGATGGCATGCTCGGAGCCATGCATGCATGCTTTCGCATTGTCTC TTTCAGAAAATTTATGTGTTTTGAAGAACTCCCGAATATAATTAATAACAAGAAATTGGTTTGCGGTAGGGGGGAAAAGACATGAAACTAGAGAAGAGGAGATTCGAGGAGGCCCCCCCTTATACCTGGCATCATCATCATCAAGCTTTTCTATGTTCTGACAAAAAAGAAACATTATAGAAATGGAGGAGCCTTGGAAATGATGTTCAGGTGAATTGTCTTAGCTACCTAATTATATATATTATTATAAACTGTTTCCAACTCAAAAGCTACTGCAGGGCAGGGCATTGGAAAAGGAATTCATTTGCGCCATTTTTCCTATAAATAAGTGCTGGCCGGAGACGGAGAGTAGACCCAGTTTAAATGTTTTGCATCATTACTTTGTTCAAGAATATATTATGGTATACTTAATTAAGTAGTAGTTTTGGTTCTGTTTTGAAGGTATGTTTGTGTGCCTGGCTCCTTGTATGCCATTCGTGGAGTCTATCCATGCGCGGCCAGCCTTCGTGGATGGCATGCTCGGAGCCATGCATGCATGCTTTCGCATTGTCTCCACACCTACTCTCATTTTCAGGCTTTTCTCCTCAGTTACTACATATGAAACTTCATCATTTCGTAGTTCAATCATCTGTTTCGTGCCTCGTCCAAATCAAAGGTAATTAATAAAATAATTTTTTCCTTAGTTTACAATCCAATCCTTGCTACAAATGTATAGTAGCTTTTATAAATGGCCGTACCTTTGGATTCTTCCGACCTATAAATTGTTTCAATGTTTAATAATGAGATATCTGTATCACAGATTATTTTGAAACAAACATGTATGGAAAAGTTTATCACAAGATTTGGTTACATTTTCCAATGGTTTCAA 3 0 5' arm Ocimum_basilicum mirnest mir-160 0.0001 tcc-MIR160b 2.0E-9 -51.4 ......(((((((((((....((((.(((((((..(((((((((((((((((.((..((......))..)).)))))))))))))))))..))))))).)))))))))))))))......... (-51.4)