mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATTCGTCTCGCAGTTTACAGG TGTAAATTGTGAGACGAATCT TAAAAACCAATTGCACAGTTCGCGTGTAAATTGTGAGACGAATCTTTTAAACCTAATTGCGTCATGATTTGACAATGTGATGCTACAACAAATATTTGCTAATGATGGATTGATTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTACAGGTGGAATCTATAATTTGTTTTGTTATTAGT TAAAAACCAATTGCACAGTTCGCGTGTAAATTGTGAGACGAATCTTTTAAACCTAATTGCGTCATGATTTGACAATGTGATGCTACAACAAATATTTGCTAATGATGGATTGATTAGGCTTAATAAATTCGTCTCGCAGTTTACAGGTGGAATCTATAATTTGTTTTGTTATTAGTCTACATTTAATACTTCAAATGTGTGTCTGTATGCTTCAAAAACACGTAAAGAACTAAACAAGGCCTTAGTGGTTCAAAATGCCAAAAAAAGGCTAAGTGAAATCCTGTGGTCACGTTTGCTTTATGGAGTATCTTGTCCTATCCAGGTGGGGTCTATCTAGATGAGAAATGCTTGGCTGATGAGTGATAATATATGTGTGGTGTCAATCTGATATGCTTTTGCATTTTCAAAAAAATTTTTTTGATAAAGAGAGATTTTATTAATATTCAGTAGATACTGCTATTCTACCAGGTACCTACAGGTAAGAGAAGCATGAACAATCAGCAGCAGCATTCTACAAAAAGGTTTTGGGGGGCAAAAGCATGCTTTTCAGGGTTGCAGGATGGTACAACTATCACTGCATTGTACACCAGCTGATTGAGCCTTGGAAGGTCCCATGCCCGTGGGGCCCGCATGTCAGTGGGAGAGTGCCCCTTCAGTAACTGCAGAGAGACCCCCTGTAGCAGTCTGTTGTTGCAACCGAATGCATGATTCCCTGCAGGATCAGGCACAAGTTGCTTCCGTACAGTCCAAAAGAGC 1 0 3' arm Panicum_virgatum mirnest 100 osa-MIR2124a 6e-50 -48.5 ..(((((.(((((.....(((((.(((((((((((((((((((...((((.((((((((((((((.(((((....((((....)))).)))))........))))))...)))))))).))))...))))))))))))))))))).))))).....))))).)))))......... (-48.5)