mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGACCAAGTTGATAGAAAAG TTCTCTATAAATTTGTCCAAAT TGAGTACTGATAAGTGGTTTGTCCTAACTCCTAAGTCAAACTGTTCTAAGTTTGACCAAGTTGATAGAAAAGATTAATAATATTTTGATTATCAAATGAGAAGAATTAGATCCATCATGAAATATGTTTCCATAATTTACTTATTTGATGTGTTATAGTTGTTAATGGTTTTTCTCTATAAATTTGTCCAAATTTAGACTACTTTGACTTAGGACAAACCAAAATATCTTATATTTCATGA TCGCTCAGTAACTACTTGAAAAAGAAAAAGAAAAGGACTTGGTGTGCATACAAAATGGGTCTAGGTACTTGACATGATTTTGGATTGGGACGCCTCATAAATCAATCTAGCTCATTGTTAGTAGAGGAGCTTGACTTAGATTGATTCCTGATCAAGCTGGTTTGGATGTCTTGGCCCATATTAGTGCTTACTGCGTATTTTTGCATTTGCATGTATTCCTGCTTGGTATGTATTATGGATAGCTTCAGCTTTAGTTCAACTTGAAATTGGGAACACACTTAATTTGAGTACTGATAAGTGGTTTGTCCTAACTCCTAAGTCAAACTGTTCTAAGTTTGACCAAGTTGATAGAAAAGATTAATAATATTTTGATTATCAAATGAGAAGAATTAGATCCATCATGAAATATGTTTCCATAATTTACTTATTTGATGTGTTATAGTTGTTAATGGTTTTTCTCTATAAATTTGTCCAAATTTAGACTACTTTGACTTAGGACAAACCAAAATATCTTATATTTCATGACAGATGGAGTATATTGTGAGTGTACCCCAGATTTGATCACACCATGCTTATTGGGTCCCCTAAAGAGACAATATCTTTCCGGACGTAGAATGGTCATAGTGAAGAGATCCCCTGAAAAATATTGATAATTACTCTTTTTCTTTTCTTGAATGCTTCTGCTTTTTATCCCCTGAAAGTTGCACGTCCCTCCGCATCCAACCAATAGCTTTTGGGC 3 1 5' arm Panicum_virgatum mirnest 100 osa-MIR437 0.00000005 -63.5 ((((....((((..((((((((((((.......(((((((.((.((((((((((..((((((.(((((((((((((.(((((..(((..(((((((((((..((((((.......((((...))))......)))))).))))))))))).....))).))))).)))))))).))))).))))))..)))))))))).)).)))))))))))))))))))...))))......))))... (-63.5)