mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCACA TGCTCACTCCTCTTTCTGTCAGC TGCAATCTGCAAAGTAAGGTCAGCTCCTCCGCGGAGAATCCCTCAAGAGATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGTGATGTCCGGCATAACATGTATGCCGTCTTCGCCGCGTGCTCACTCCTCTTTCTGTCAGCCTCTTTCTCTTGGGAGTTCACCTTACATTCAGATCCACAAGTGGGTTT TCACCGGATCCCAAGAAGAAAAAACCTCTCCGGCTTCCTGCTGTGTTCTGAGGTTTTATTTGGGTTTTTCTTTCCGATTTTTGGGTTGTTGGCAATTTGTGTGCCGATTTTTGGAAGTTGGTCTTCGATTGTGCAATCTGCAAAGTAAGGTCAGCTCCTCCGCGGAGAATCCCTCAAGAGATTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGGCGTGATGTCCGGCATAACATGTATGCCGTCTTCGCCGCGTGCTCACTCCTCTTTCTGTCAGCCTCTTTCTCTTGGGAGTTCACCTTACATTCAGATCCACAAGTGGGTTTGTAGAGCCAATTCGATTCAATTTCAGTTCGGTACTTCATATTTTTCCCAACAAGAAAGAAGGTTAAACCCTGCTTGTAAGAAAGAAACTCAGCCACAAAAGACTCAACACGCATGCGGCAAGTACTCAGGCTTTTCTCCTACTTTTTACCATGCCACTTCCTTATCTCTTAGATGTATGGGGAAGCAAAAAAAAAATTCGCTCTGTTCTTTTGATCTTTCCTGTCAAGTTGCCTTTGGGAGCTACTACCGAGGAGAGTGATACGGATGCCAGTGGTAATTGTAAGGAGCAGCAGCTGTAGGCGCTTGCGGTACTGGAATAAATGATTGGATTTGTTACTTGTTTTTCTCATCCCCAAAATGTTTTTTTCTTCTCCTTTTGTAGTGTACTCGCCTTGGGAGCTGGATCATGGAGATGCTGCCGGTACCCTGCGACGCTGTGGTGATTTATACATGCATCTCCT 2 2 5' arm Avena_barbata mirnest mir-156 1e-29 bdi-MIR156c 9e-43 -83.7 ((((...))))..(((((((.(((((((....((((((.......((((.((((((((((.((((((((((.(((((.((....(((((((.....)))))))))..))))).))))))))))...)))))))))).)))))))))).))))))).))))))).....((((((....)))))). (-83.7)